进入云野神殿的核心方法是前往云中仙乡的三塔区域，依次激活三座钟塔，再乘坐出现的遥鲲飞往高处。进入云野不需要提前收集光之翼或完成全部先祖，但必须先从遇境进入云野，并沿主路线抵达蝴蝶平原；真正通往神殿的关键条件只有三座钟塔全部点亮，少点一座时遥鲲不会按正常路线出现。
推荐按照“遇境—云野大厅—蝴蝶平原—云中仙乡—三塔区域”的顺序前进。进入云野后穿过大厅前方的云洞，落到蝴蝶平原，沿前方主通道穿过石门或长廊进入云中仙乡，不要误入左右两侧隐藏图。到达三塔区域后，先观察三座分布在不同浮岛上的钟塔，分别飞到塔身附近，烧掉附着在塔上的黑暗植物，再点燃塔下或塔旁的钟塔蜡烛。每座塔都要完成“清除黑暗植物＋点燃钟塔”两步，三座全部完成后，空中的遥鲲和蝴蝶会被钟声吸引过来，神殿方向也会出现明显的飞行引导。
新手应先补充能量，再按近岛到远岛的顺序激活钟塔。每次飞往下一座塔前，优先经过云层、白色蝴蝶或蜡烛附近恢复能量，起飞时采用短距离滑翔，接近岛屿后再切换上升飞行，能减少因能量不足坠入云海的情况。三座塔点亮后不要继续绕岛寻找隐藏入口，直接观察遥鲲的飞行路线，靠近它的背部并点击骑乘；如果错过遥鲲，可在三塔附近等待下一次经过，不必重新点燃已经激活的钟塔。多人同行时可以分头清理三座塔，单人则建议先完成距离最近的两座，再利用中间岛屿补充能量后处理最后一座。
最容易走错的是把右侧钟塔下方的洞穴当成神殿入口，那里通往云野中央神坛，属于隐藏区域，并非前往神殿的主路线；该区域通常需要两名光之子配合引蝶动作，且要先收集6位云野常驻先祖才能通过屏障。抵达神殿后，沿正门进入大厅，点亮中央祭坛并坐下冥想即可触发先祖相关内容；若只是想完成云野主线，看到神殿大门和前方锦鲤池就说明路线已经成功，继续按祭坛提示操作即可进入下一阶段。
