完整通关天际、丛林、沙漠三大主线主题后，即可在游戏主界面解锁深海模式入口，完成前置主线是开启深海章节的硬性基础条件，无需额外付费或特殊道具，通关前三主题全部基础关卡后，主界面主题选择栏会自动刷新出深海板块，点击就能进入深海前九关免费冒险关卡，后续深海隐藏关卡与BOSS关卡则需要依托怪物窝养成机制逐步解锁。
推进主线解锁深海入口时，需要将天际、丛林、沙漠每一张地图的常规关卡全部拿到通关判定，不用强制达成金萝卜评价，只要守住萝卜完成每一关怪物波次即可，每通关一张完整主线地图，游戏会解锁对应炮塔与怪物蛋掉落机制，这两类资源也是后续解锁深海后半段关卡的核心素材。通关沙漠最后一关后退回主界面，原本空白的主题栏会出现带有潜水萝卜标识的深海图标，点击图标直接跳转深海第一章地图，前九关无需任何养成条件，能直接反复挑战刷取深海专属怪物蛋、饼干与牛奶道具，关卡内的珊瑚、贝壳、沉船宝箱被摧毁后会掉落礼盒，礼盒开启大概率产出孵化怪物所需材料，为解锁深海隐藏关提前储备资源。
深海模式分为免费基础关、养成解锁隐藏关、专属BOSS关卡三个板块，前九关解锁无门槛，第十关至第十八关的隐藏关卡，必须收集对应深海怪物蛋，在怪物窝完成孵化、喂食养成才能逐个开放。每一只深海怪物都需要专属窝位放置，搭配足量饼干和牛奶完成成长阶段，不同隐藏关卡对应指定养成怪物组合，例如深海第十六关需要同时养成绿咪儿、木奶娃、墨镜阿庆三类海洋怪物，全部养成成熟后对应关卡锁会自动解除。刷取怪物蛋优先反复挑战深海第九关，该地图障碍物密集、礼盒掉落概率更高，一局能产出多个礼盒，大幅缩短收集养成材料的周期，养成过程中不要遗漏怪物窝每日产出的小额饼干牛奶，长期积累可以减少重复刷关的时间成本。
进入深海模式后会解锁全套海底专属炮塔，船锚炸弹、鱼刺、章鱼塔、毒针、冰冻星星仅能在深海地图建造使用，章鱼塔大范围溅射伤害适合清理成群小鱼怪，鱼刺附带短暂眩晕控制，冰冻星星降低海洋高速怪物移速，搭配船锚炸弹清理障碍物效率极高。深海独有的怪物种类包含喷墨章鱼、高速鱼群、高血量海龟、巨鲸BOSS，巨鲸BOSS会在深海BOSS关卡登场，拥有大范围冲撞攻击，布阵时需要在道路多处布置减速炮塔分割怪物集群，避免BOSS配合小怪同时突破防线。地图内存在潮汐地形设计，部分路段会周期性改变通行范围，建造炮塔优先选择地势稳定的转弯点位，防止潮汐变化压缩输出空间，前期经济不足时优先建造深海蘑菇，摧毁障碍物额外产出金币，稳定经济循环便于快速铺满输出炮塔。
部分玩家会出现通关前三主线后深海入口未显示的情况，多是主线关卡存在遗漏未通关的地图，返回天际、丛林、沙漠逐一核对关卡列表，补齐所有未完成关卡后重启游戏即可刷新深海入口；若深海第九关通关后隐藏关卡依旧锁定，检查怪物窝内怪物的成长进度，未成熟的怪物无法触发关卡解锁判定，补充喂食材料完成全部养成阶段就能解锁剩余关卡。深海模式整体难度梯度平缓，前九关适合新手熟悉水系炮塔搭配，隐藏关卡与BOSS关卡更考验减速、群攻、单体输出炮塔的组合思路，熟练掌握怪物窝养成节奏，就能完整解锁深海全部22张地图，体验完整海底塔防内容。
