纪念碑谷静谧庭院通关核心是灵活调整水流走向、操控水位高低，配合建筑旋转产生的视觉通路推进解谜，关卡分为四段独立场景，水流机关是贯穿全程的核心解谜要素，多数玩家卡关的原因在于没有按照顺序激活阀门，盲目调整水位导致道路被阻断。进入初始庭院场景后，优先点击塔楼顶端十字形旋转水阀，依次调整出水口朝向三处不同水渠，水流灌入水槽后会下沉平台，逐步搭建通行道路。引导艾达顺着台阶移动，每一次调整水阀之后，确认脚下道路完全连通，再进行下一次旋转，三次水路全部导通后，庭院深处的通道大门就会开启，由此进入高塔场景。
高塔场景布满可滑动泄水挡板与地面压力机关，整个塔楼支持旋转切换正面与背面视角。先旋转建筑露出塔楼后方平台，操控角色踩下压力开关，解锁顶部水位控制滑块，向上拖动滑块降低整片区域水位，水下隐藏平台随之显现。移动至底层第二个压力机关，触发机关后塔楼外壁浮现旋转把手，转动把手调整中层悬空通道的角度，将通道调整至可通行状态。随后再次调整水位滑块抬高水面，沿着中层通道前往塔楼正面，踩踏屋檐下方机关解锁上层平台，将三块泄水挡板全部下拉，水位升至最高点，沿着顶层道路进入下一处暗空间。
暗空间场景没有水流机关，依靠视觉错位完成通路拼接，也是剧情触发节点。缓慢旋转场景几何体，调整两侧高台角度，让两段断开的道路在视觉上衔接，引导艾达抵达幽灵所在平台。完成剧情互动之后，暗空间底部通道解锁，进入最终庭院场景。这一区域存在巨型水车与多处分流阀门，解谜目标是搭建完整水流闭环，不要优先触碰中央引水开关，先依次踩下周边压力按钮，逐个调整分流阀门摆放角度，理顺所有水渠走向，确认整条水路不存在断点，最后激活引水开关，水流循环带动水车运转，右侧出口道路开启。
